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【预期用途】
本产品就是以染料法荧光定量 PCR 技术为基础开发的专门检测的试剂盒。
【检验原理】
本试剂盒可在一次反应中快速检测五种病原体:肺炎链球菌 1 型、3 型、4 型、5 型、6 型。肺炎链球菌的血清型分类是基于其荚膜多糖抗原结构的差异,目前已发现的血清型超过 100 种。不同血清型在致病力、流行特点、好发人群和引起的疾病类型上存在显著差异。1 型和 5 型是经典的致病菌,在成人和儿童中均占有重要地位,且与脓胸等并发症相关。3 型因其独特的生物学特性而成为毒力最强的血清型,需要警惕其导致的高病死率。型属于常见致病血清型,广泛存在于各类感染中。6 型(特别是 6B)则是儿童感染的“主力军”,且耐药问题较为突出。根据探针法荧光定量 PCR 原理开发。
【试剂组成】
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名 称
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规 格
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2 × Probe qPCR Mix
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700uL×1管
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ddH2O
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1 mL×1 管
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五重 qPCR 引物混合液
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2 00uL×1 管
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五重 qPCR 探针混合液
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110 uL×1 管
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五重 qPCR 阳性对照(1×10E8 拷贝/μL)
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50μL
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说明:不同批号的试剂盒组分不可交互使用。
【运输及保存】
避光-20±5℃保存,有效期12个月。开封后避光-20±5℃保存,对有效期没有影响;
冰袋低温运输4天、反复冻融5次对效期没有影响。
【自备试剂】
样品 DNA。
【适用仪器】
ABI 、安捷伦MX3000P/3005P、LightCycler、Bio-Rad、eppendorf等系列荧光定量PCR检测仪。
【使用方法】
一、核酸提取(样本制备区)
用自选方法提取纯化样品 DNA,本试剂盒跟市场上大多数核酸提取试剂盒兼容。
二、稀释标准曲线样品(样本制备区)
(由于阳性对照浓度高,因此下列稀释操作一定要在独立的区域进行,避免污染样
品或本试剂盒的其他成分)。
1. 标记 6 个离心管,分别为 7,6,5,4,3,2。
2. 用带芯枪头分别加入 45 μL ddH2O,(最好用带芯枪头,下同)。
3. 在 7 号管中加入 5 μL 1×10E8 拷贝/μL 的阳性对照(试剂盒提供),充分震荡 1 分钟,得 1×10E7 拷贝/μL 的标准曲线样品。放冰上待用。
4. 换枪头,在 6 号管中加入 5 μL 1×10E7 拷贝/μL 的阳性对照(上步稀释所得),充分震荡 1 分钟,得 1×10E6 拷贝/μL 的标准曲线样品。放冰上待用。
5. 换枪头,在 5 号管中加入 5 μL 1×10E6 拷贝/μL 的阳性对照(上步稀释所得),充分震荡 1 分钟,得 1×10E5 拷贝/μL 的标准曲线样品。放冰上待用。
6. 重复上面的操作直到得到 6 个稀释度的标准曲线样品。放冰上待用。
若无需制作标准曲线,将阳性对照稀释到 1×10E5 拷贝/μL 即可。
三、试剂配制(试剂准备区)
准备足量的 qPCR 管(样品管、阴性对照管、阳性对照管),向各 qPCR 管中分别加入下列成分。:
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成分
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N个
待检样品管
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qPCR
阴性对照管
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qPCR
阳性对照管
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2 × Probe qPCR Mix
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各 12.5 μL
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12.5 μL
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12.5 μL
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五重 qPCR 引物混合液
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各 4 μL
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4 μL
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4 μL
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五重 qPCR 探针混合液
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各2μL
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2μL
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2μL
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ddH2O
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各 4.5 μL
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4.5 μL
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4.5 μL
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转移至模版添加区
四、添加模板(模板添加区)
向 qPCR 管中分别加入 2ul 模板,顺序为阴性对照(ddH2O)、待测样品模板、五重qPCR 阳性对照,离心 30 秒,立即进行扩增反应。
五、扩增反应(扩增及产物分析区)
将 qPCR 管放置在 qPCR 扩增仪器样品槽相应位置,进行扩增,扩增程序如下:
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过程
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温度
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时间
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预变性
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95℃
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3 min
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qPCR 反应
(40 个循环)
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95℃
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15sec
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60℃
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20sec
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信号通道
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同时选择 FAM/HEX/ROX/Cy5
通道采集荧光信号
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荧光基团和猝灭基团选择如下表:
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Target
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荧光基团
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猝灭基团
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肺炎链球菌 1 型
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FAM
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MGB
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肺炎链球菌 3 型
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HEX
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None
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肺炎链球菌 4 型
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ROX
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MGB
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肺炎链球菌5 型
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Cy5
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MGB
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肺炎链球菌6 型
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Cy5.5
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BHQ2
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【结果判定】
1. 如果制作标准曲线,则以阳性对照浓度的 log 值为横轴,以 Ct 值为纵轴,绘制标准曲线。再以待测样品的 Ct 值从标准曲线上推算出样品 DNA 浓度的 log 值,推算出其浓度。
2. 如果未制作标准曲线,按照如下标准判定结果:
阳性对照结果:Ct 值<30,有明显指数增长,呈典型的 S 型曲线。
阴性对照结果:Ct 值>38 或无 Ct 值,无明显指数增长期和平台期。
样本检测结果:Ct 值<35,有明显指数增长,表明样本中检测出该菌种,结果为阳性;Ct 值>38 或无 Ct 值,表明样本中未检测出该菌种,结果为阴性;Ct 值在 35-38 范围,应对样本进行复检,如重复实验结果 Ct 值仍在 35~38 范围,有明显指数增长,则判定为阳性,否则为阴性。
【注意事项】
1. 所有操作严格按照说明书进行;
2. 试剂盒内各种组分使用前应自然融化,完全混匀并短暂离心;
3. 反应液应避光保存;
4. 反应中尽量避免气泡存在,管盖需盖紧;
5. 使用一次性吸头、一次性手套和各区专用工作服;
6. 样本处理、试剂配制、加样需在不同区进行,以免交叉污染;
7. 实验完毕后用 10%次氯酸或 75%酒精或紫外灯处理工作台和移液器;
8. 试剂盒里所有物品应视为污染物对待,并按照《微生物生物医学实验室生物安全通则》进行处理。
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